分子雜交箱廣泛地使用于克隆基因的篩選、酶切圖譜的制作、基因組中特定基因序列的定性、定量檢測和疾病的診斷等方面。因而它不僅在分子生物學領域中具有廣泛地應用，而且在臨床診斷上的應用也日趨增多。根據不同實驗的需要可以選擇不同的規格型號的雜交儀。是現代實驗室采用雜交技術的理想設備，可替代塑料雜交袋和水浴搖床，并避免雜交袋破損帶來污染危險。雜交爐采用微機控溫準確，升溫速度快等特點。
雜交，指組織或細胞的原位雜交，它與菌落的原位雜交不同，菌落原位雜交需裂解細菌釋出DNA，然后進行雜交。而原位雜交是經適當處理后，使細胞通透性增加，讓探針進入細胞內與DNA或RNA雜交。因此原位雜交可以確定探針的互補序列在胞內的空間位置，這一點具有重要的生物學和病理學意義。例如，對致密染色體DNA的原位雜交可用于顯示特定的序列的位置；對分裂期間核DNA的雜交可研究特定序列在染色質內的功能排布；與細胞RNA的雜交可準確分析任何一種RNA在細胞中和組織中的分布。此外，原位雜交還是顯示細胞亞群分布和動向及病原微生物存在方式和部位的一種重要技術。
分子雜交箱使用的注意事項：
1.在進行同位素標記的雜交實驗時，必須對雜交管的密封情況進行檢查，防止引起污染。如果發生污染，需要將情況及時匯報給有關部門的使用人員和檢修人員，使不必要的傷害盡可能的減少。
2.因為分子雜交儀具有緊湊的結構和較高的密封性要求高，因此，當儀器運行中有故障出現，應當將電源切斷，及時告知專業技術人員。
3.電源插座的接觸良好。
4.當接觸在高溫狀態時，對雜交管進行裝取，留心，不要燙傷。
5.在裝入反應液前，需要保持雜交管清潔，在將反應液和反應膜裝入后，必須將瓶蓋擰緊，防止漏液。
